Olá luccasdesa,
Primeiramente. Você usa MAC? Caso sim eu recomendaria usar o Poker Tracker 4 versão para MAC.
>> https://www.pokertracker.com/products/PT4/download.php?os=mac
Segundo, por estares usando um emulador de Window pode ser que o mesmo esteja causando o problema, mesmo assim tenta o seguinte:
Fecha a PokerStars.
No Hold'em Manager 2 vai em HUD Settings -> HUD Designer -> Reset -> Marca Panel Position e da OK. Fecha o Hold'em Manager 2
Abre a PokerStars e vai em Options -> Prefered Seat... e marca a opção Always Auto-Center Me.
Abre o Hold'em Manager 2, joga algumas mãos e verifica se o HUD vai para a posição correta depois de ter participado de ao menos 2 mãos.
Abraço!