Es geht dabei einfach um Körperproportionen und die Position der Stange. Bei einer Frontkniebeuge ist es unmöglich die Knie hinten zu halten, da gehen die Knie nach vorn während der Oberkörper möglichst gerade bleibt, so dass die Stange wieder balanciert über der Mitte des Fußes ist. Bei einer Highbar Squat, sind die Knie schon weiter hinten, dafür wird der Back Ankle kleiner, also man muss sich weiter nach vorne lehnen um eine balancierte Position zu kriegen. Bei der lowbar Squat ist der Rückenwinkel am kleinsten also ca 45 Grad nach vorne gebeugt, was es ermöglicht die Knie weiter hinten zu haben. Ein Stückchen über die Zehen werden sie trotzdem gehen, weil man sonst eher einen Good Morning als eine Kniebeuge macht, weil der Back angle noch kleiner werden muss um eine balancierte Position hinzukriegen. Die Position der Knie ist außerdem individuell unterschiedlich, was vor allem damit zusammenhängt, dass das Verhältnis Oberkörper/Unterkörper UND Oberschenkel/Unterschenkel bei allen Menschen verschieden sind. Ein Mensch mit eher kurzen Unterschenkeln wird die Knie weiter hinten haben als ein Mensch mit langen Unterschenkeln.
Um die korrekte Position zu ermitteln, sollte man einfach mal ohne Stange in die Hocke gehen und seine Knie mithilfe der Ellbogen nach außen drücken. Die Knie werden nur ein kleines Stück über die Zehen ragen, genau so weit sollte man sie bei einer lowbar Squat nach vorne kommen lassen und das passiert in den ersten 30% der Bewegung, ab da sind die Knie UND der Rücken positioniert und nurnoch die Hüfte bewegt sich.

Warum irgendeiner Variante "schädlicher" sein soll als andere ist mir nicht klar. Sie ist ja nicht automatisch schädlicher weil die Belastung auf die Knie höher ist! Beispiel olympische Gewichtheber, die beugen 6 mal die Woche sehr tief, meißtens eher Quad dominant also mit Knie nach vorn. Beim Reißen und Stoßen sind diese Positionen ebenso essentiell. Im Schnitt ist die Verletzungsrate beim Gewichtheben aber um ein vielfaches geringer also bei den meißten anderen Sportarten.